Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWX0

Ighv1-19, Immunoglobulin heavy variable V1-19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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