Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm29038-201ENSMUST00000191543 678 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
AU022751B1B0V2 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
AU022751B1B0V2 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124 ms