Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm25753-201ENSMUST00000116792 121 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim35Q8C006 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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