Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AC092568.1-201ENST00000440950 1284 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 MRPS16P2-201ENST00000445106 408 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 OGFRP1-203ENST00000446578 551 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AC073336.1-201ENST00000448767 664 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AL663058.1-201ENST00000453379 353 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 RPL3P6-201ENST00000474162 1204 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 DKK2-204ENST00000513208 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AL662844.2-201ENST00000538455 284 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 ZMYND19P1-201ENST00000554267 787 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AC020892.2-201ENST00000557891 387 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AC096996.2-201ENST00000563906 426 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 Z94057.1-201ENST00000569593 847 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AC090079.1-201ENST00000572092 1183 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 MIR5003-201ENST00000581891 99 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 RN7SL411P-201ENST00000585204 300 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 NUMB-202ENST00000356296 3453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 LINC01568-201ENST00000554640 2544 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 PGCP1-202ENST00000436252 1358 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 FAM239B-202ENST00000424415 2194 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 EML4-202ENST00000401738 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 EFHC1-214ENST00000636107 3530 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 ALG9-210ENST00000531154 1930 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 MIA3-202ENST00000344507 2026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 FRG2LP-201ENST00000586090 1563 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 C11orf49-202ENST00000378615 1651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 LMO7-218ENST00000526202 4121 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 VPS11-208ENST00000621676 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AC209007.1-201ENST00000401075 1342 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 TPK1-201ENST00000360057 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 HRH1-204ENST00000438284 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 CARD8-213ENST00000519940 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 MAGED1-204ENST00000375772 2701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 ACSM3-202ENST00000440284 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 BVES-203ENST00000446408 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 HS6ST3-202ENST00000620595 7073 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 LRRC4C-207ENST00000619527 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 NLRP4-201ENST00000301295 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 RTN3-206ENST00000377819 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 MROH5-205ENST00000621837 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 ADSL-208ENST00000623063 4359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 RPL21-201ENST00000272274 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AL355864.1-201ENST00000401937 526 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AC009494.1-201ENST00000406090 455 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 FAM192BP-201ENST00000414628 762 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AC010998.1-201ENST00000414774 943 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AP000529.1-201ENST00000417657 1123 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 HCG23-205ENST00000426643 610 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AC079779.2-202ENST00000427831 392 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 LINC01282-201ENST00000431646 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AL121929.1-201ENST00000457120 524 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 TCEAL4-212ENST00000494801 1008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 DERL1-205ENST00000523036 542 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AP004607.8-201ENST00000526848 323 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 OR4A1P-201ENST00000532342 920 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 PGA5-205ENST00000541528 867 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AC087516.2-203ENST00000558875 601 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AC006262.2-201ENST00000599127 612 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 RPS20-212ENST00000618656 627 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 AL137798.3-201ENST00000639399 166 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 CEACAM5-210ENST00000617332 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 ST5-237ENST00000530991 3396 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 ZIK1P1-201ENST00000456074 1459 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PSEN1P49768 USP17L13-201ENST00000429667 1593 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms