Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms