Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms