Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec4eQ9R0Q8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms