Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Copg1Q9QZE5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms