Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms