Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trappc2lQ9JME7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms