Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3m1Q9JKC8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms