Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms