Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Exosc9Q9JHI7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Exosc9Q9JHI7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Exosc9Q9JHI7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Exosc9Q9JHI7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms