Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD8

Parvg, Gamma-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvgQ9ERD8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ParvgQ9ERD8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ParvgQ9ERD8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ParvgQ9ERD8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ParvgQ9ERD8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ParvgQ9ERD8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ParvgQ9ERD8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ParvgQ9ERD8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ParvgQ9ERD8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ParvgQ9ERD8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ParvgQ9ERD8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ParvgQ9ERD8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ParvgQ9ERD8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ParvgQ9ERD8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ParvgQ9ERD8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ParvgQ9ERD8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ParvgQ9ERD8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ParvgQ9ERD8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ParvgQ9ERD8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ParvgQ9ERD8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ParvgQ9ERD8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ParvgQ9ERD8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ParvgQ9ERD8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms