Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ44

Vmn1r41, Vomeronasal type-1 receptor 41, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r41Q9EQ44 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Vmn1r41Q9EQ44 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Vmn1r41Q9EQ44 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Vmn1r41Q9EQ44 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r41Q9EQ44 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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