Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap1Q9EPJ9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms