Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabarapQ9DCD6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GabarapQ9DCD6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GabarapQ9DCD6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GabarapQ9DCD6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GabarapQ9DCD6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GabarapQ9DCD6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabarapQ9DCD6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GabarapQ9DCD6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabarapQ9DCD6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabarapQ9DCD6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabarapQ9DCD6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabarapQ9DCD6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabarapQ9DCD6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabarapQ9DCD6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabarapQ9DCD6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabarapQ9DCD6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabarapQ9DCD6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabarapQ9DCD6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GabarapQ9DCD6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabarapQ9DCD6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabarapQ9DCD6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabarapQ9DCD6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabarapQ9DCD6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GabarapQ9DCD6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms