Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hmgn3Q9DCB1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms