Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms