Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms