Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms