Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933421I07RikQ9D420 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933421I07RikQ9D420 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933421I07RikQ9D420 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933421I07RikQ9D420 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms