Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cysrt1Q9D1E4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms