Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc167Q9D162 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms