Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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