Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
4930524J08RikQ9CUJ5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms