Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms