Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms