Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI9

Med30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med30Q9CQI9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med30Q9CQI9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms