Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700129C05RikQ9CQ77 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms