Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms