Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms