Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRTQ9BXP5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms