Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtn4Q99P72 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms