Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms