Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ophn1Q99J31 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms