Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb6Q922F4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms