Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf3Q920N1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms