Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms