Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms