Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
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Vmn1r200Q8R281 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Vmn1r200Q8R281 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Vmn1r200Q8R281 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Vmn1r200Q8R281 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Vmn1r200Q8R281 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Vmn1r200Q8R281 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Vmn1r200Q8R281 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Vmn1r200Q8R281 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Vmn1r200Q8R281 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Vmn1r200Q8R281 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Vmn1r200Q8R281 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r200Q8R281 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms