Protein–RNA interactions for Protein: Q8K441

Abca6, ATP-binding cassette sub-family A member 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca6Q8K441 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abca6Q8K441 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abca6Q8K441 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms