Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rasgef1bQ8JZL7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rasgef1bQ8JZL7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rasgef1bQ8JZL7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rasgef1bQ8JZL7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rasgef1bQ8JZL7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rasgef1bQ8JZL7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rasgef1bQ8JZL7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rasgef1bQ8JZL7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rasgef1bQ8JZL7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rasgef1bQ8JZL7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rasgef1bQ8JZL7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rasgef1bQ8JZL7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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