Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms