Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lrrn3Q8CBC6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Lrrn3Q8CBC6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Lrrn3Q8CBC6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Lrrn3Q8CBC6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Lrrn3Q8CBC6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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