Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoa5Q8C7G5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa5Q8C7G5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa5Q8C7G5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa5Q8C7G5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa5Q8C7G5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa5Q8C7G5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa5Q8C7G5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa5Q8C7G5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa5Q8C7G5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa5Q8C7G5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa5Q8C7G5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa5Q8C7G5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa5Q8C7G5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa5Q8C7G5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa5Q8C7G5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa5Q8C7G5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa5Q8C7G5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa5Q8C7G5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa5Q8C7G5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa5Q8C7G5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa5Q8C7G5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms