Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfrp1Q8BXL7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfrp1Q8BXL7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms