Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc9Q8BJN4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms