Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms