Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms